1960 in Duisburg geboren, bekam Martin Becker mit 12 Jahren den ersten Flötenunterricht. Nach ersten Preisen bei "Jugend musiziert" und einem Stipendium des Landes Nordrhein-Westfalen wurde er 1977 Jungstudent bei Hans-Jürgen Möhring am Robert Schumann-Institut in Düsseldorf.
Nach Abitur und Zivildienst gewann er 1980 den ersten Preis des Hochschulwettbewerbs und schloss das Studium 1984 mit der Künstlerischen Reifeprüfung und 1986 mit dem Konzertexamen ab.
Neben Lehraufträgen an der Universität Köln und der Musikhochschule Düsseldorf erhielt er 1985 ein Engagement als Solo-Flötist bei den Hofer Symphonikern. 1986 erfolgte der Wechsel zum Kölner Rundfunk Sinfonie Orchester des WDR.
Martin Becker engagiert sich weiterhin als Assistent des Landesjugendorchesters (LJO) Nordrhein-Westfalen, dessen Patenschaft das WDR-Sinfonieorchester übernommen hat, und ist auch als Kammermusiker tätig.